菌種是食用菌生產的基礎，母種是菌種的基礎，本文從多個角度講解如何判斷母種的質量，母種應該用最嚴格的標準進行判斷。
1、污染率
盡量做到沒有污染，或者極低的污染率，否則就說明技術不過關，一定要加強母種制作技術，母種是食用菌生產的基礎，這也是下面判斷母種質量的基礎。
2、萌發速度
接種后，24小時觀察要明顯萌發，48小時完全萌發并且開始向培養基中生長，萌發速度不僅可以判斷轉接后母種的表現，也可以判斷原母種的質量。
3、生長速度
不同品種，不同試管大小，不同斜面長短，不同培養基等的不同，母種的生長速度都會不同，要在自己的固定模式下比較母種的生長速度，合適溫度下，如果生長偏慢為不正常，一般母種長滿管的時間為10-15天。
4、整齊度
菌絲開始應該呈圓周狀生長，后來整齊的向斜面兩側生長，向兩側生長的速度相同，菌絲前端的生長狀態要整齊。
5、濃密度
一般來說，菌絲生長的濃密、潔白為正常的表現，如果菌絲稀疏、灰暗則視為異常。
6、一致性
一次轉接的所有母種應該在生長速度、濃密度、整齊度上的表現一致，當然這和轉接的技術有關，比如接種快的大小。
7、無性孢子
對于某些可以產生無性孢子的品種，如果出現較多的無性孢子為異常。
8、顏色
對于大多數品種，菌絲應該為白色，如果出現異常顏色要判斷是否為污染導致，同時注意因為高溫、見光、品種退化等也會導致出現異常顏色，比如平菇母種部分呈橘黃色，這種情況并不是不能使用，但是要盡量避免。
9、氣生菌絲和爬壁菌絲
不同食用菌品種母種的氣生菌絲和爬壁菌絲狀態是不同的，有的有爬壁菌絲，有的幾乎沒有爬壁菌絲，要根據不同品種的特性去判斷，對于氣生菌絲來說，一般認為過多的氣生菌絲是不正常的。
10、鏡檢
如果具備顯微鏡，可以抽樣鏡檢觀察菌絲是否符合該品種的基本特征，是否具有鎖狀聯合等。
如果以上一項嚴重不符合要求，就是為母種不合格，應該慎重使用。
如果以上多項不符合要求，該批次母種應該整批淘汰，并查找原因。
